二十世紀九十年代，一系列因素使物流在大多數企業中的作用發生變化。質量評價和業務重組使企業從整個過程而不是從單個部分考察物流，從而產生了對商品、信息和資金進行一體化控制的供應鏈管理。供應鏈管理試圖開發商品生產和客戶服務的統一流程，物流已不再只是使成本最小化的機會，而是企業盈利的核心成分。
近年來，隨著互聯網的普及，各種類型的電子商務不斷涌現。電子商務可以從兩個方面來界定，一是參與方，即B2B或B2C；二是交易性質，包括賣方服務器、買方服務器和中立的網上市場交易。各種類型的電子商務，都對運輸、物流與供應鏈產生了深刻的影響。
一、賣方電子商務
利用互聯網進行賣方電子商務已經為運輸與物流企業所廣泛接受，特別是用于客戶服務和銷售服務產品，如讓客戶登錄公司的網站預訂服務和跟蹤貨物。
許多企業建立賣方電子商務，是看到了客戶訪問網站比撥打呼叫中心對企業更有利。由于企業不需要員工來參與交易，不僅節省了成本，而且消除了客戶/員工交流不當的風險。這種風險在企業參與全球競爭時更大，因為客戶可能在24小時內隨時呼叫。企業建立的賣方電子商務范圍各有不同，有的企業通過建立獨特的網站來創造競爭優勢，他們為每一位客戶建立個性化的門戶，提供全面的支持能力，包括根據需要使用不同的語言。
二、 賣方電子商務的障礙
運輸承運人在利用電子商務解決方案來滿足客戶的供應鏈期望時也會遇到一些障礙，主要是貨物的跟蹤問題。客戶想知道貨物的位置，希望對有時間要求的送貨出現情況時能夠得到提醒。這個問題可能以兩種形式出現：貨主和中間承運人。
如果貨主希望跟蹤每一宗貨物，他需要登錄每個承運人或物流服務商的網站，多宗貨物就需要持續在這些網站間移動，由此帶來三個問題：第一，貨主必須在跟蹤前將承運人與貨物相匹配，這有時對客戶來說是復雜和困難的；第二，承運人通常使用運輸設備ID或貨物ID來跟蹤，并不一定總是保持客戶使用的統一的貨物ID（如采購訂單、貨倉號、海關文件、看板號等），有時這會使客戶跟蹤貨物幾乎不可能；第三，也許是最重要的，客戶缺少一個專注點。所有這些都只能使客戶得到次優的結果。
有些運輸是多式聯運-涉及不止一個承運人和運輸模式，通常由一個中間承運人來協調。中間承運人必須知道運輸設備何時能使用，這也面臨一個信息分散的問題。例如他們不得不查詢多個鐵路、輪船和碼頭的網站，以了解每個運輸設備的情況。如果沒有完整的信息，中間承運人就不能優化這些設備的移動。
三、 中間商的興起
供應鏈改進對企業績效的作用引起許多企業的關注。隨著企業運行的全球化，外包越來越普遍。據統計，全球500強企業中，有60%使用第三方物流（3PL）服務，許多企業還不止使用一家。
使用3PL可以使企業通過減少運營和資金成本來改進財務狀況，同時也可以通過提供單個承運人所不具有的范圍和規模來簡化運輸采購決策。成功的3PL可以在世界范圍內提供服務，使用地面、海洋和航空等運輸方式，并可通過規模化提高效益。
信息技術使3PL能夠充分發揮規模優勢，許多客戶認為3PL比一般承運人具有系統優勢，包括客戶服務能力。最近又興起了領先物流提供商（LLP）或第四方物流提供商（4PL），作為客戶的戰略伙伴而不是像3PL那樣的戰術伙伴。4PL是供應鏈集成商，他整合自身及其他服務提供商的資源、能力和技術，提供綜合供應鏈解決方案。
4PL所需的技能是獨特的，根據物流外包所需的運行技能要求而大不相同。戰略咨詢、業務流程重組、技術整合、富有經驗人員的管理、全球能力和管理多個服務提供商能力是常用的4PL技能。4PL也可以作為信息中間商（INFOMEDIARY）提供3PL服務，這是電子商務爆炸的結果。
四、 買方電子商務
買方電子商務是企業將采購放在網上，以得到方便、及時和多種選擇的供應。如3PL可以用這種方式確保擁有充足的、有效的承運人的運輸能力。
五、網上市場電子商務
運輸行業已經分化為三類。最基本的是直接向客戶提供服務的基于資產的承運人，他們與客戶建立的是“一對一”的關系，與客戶分別簽訂雙邊合同。除此之外，有兩個新的市場形式。一是中間承運人在汽車站張貼告示，提供運輸能力及對尋求運輸能力作出響應。這種形式逐漸演變為貨運代理商通過電話、傳真和E-MAIL等形式進行貨物配載，并進而發展為3PL.
電子商務將傳統的方法在互聯網上實現。BBS最簡單，提供商收集和分布來自承運人的運載供應信息和來自客戶的運載需求信息。當承運人和客戶看到感興趣的條目時，雙方直接商洽。這一商業模式非常簡單，BBS提供商按月收取登錄費并提供服務。由于用戶很少登錄多個類似的網站，因而率先做大的提供商就會取得競爭優勢。提供商有兩個辦法來增加收入，一是擴展到其他運輸模式，這個不太容易；二是提供額外的增值服務，如提供信用支票、購買汽油和進行團體折扣等。這些服務通常由第三方提供，并向BBS提供商付費。
另一種類型的網上市場電子商務是拍賣，即通過拍賣確定運費。貨主或者將標書放在網上供承運人瀏覽和投標，或者直接要求承運人提供最優惠價格。有些承運人也會發布運能并尋求投標。投標過程是不透明的，在預先設定的日期和時間的贏方就贏得投標。這一系統似乎很直接，但也存在不少潛在的問題。客戶和承運人都可能希望縮小投標者的范圍，因而完善的拍賣需要篩選標書。拍賣的商業模式是登錄與交易費的結合，但一個很大的問題是不能確保最終中標者的履行和付費，所以有些拍賣網站試圖要求提供他們來支付運費來解決這一問題。
網上市場電子商務還可以進行交易，像商品交易一樣買進和賣出，不過目前只讓具有運輸能力的提供商參與交易，而不讓投機商參與。網上交易也存在一些問題，比如參與者可能只是彼此傳遞價格信息。
六、未來的走向
許多承運人擔心新技術會導致運費的進一步下降，的確，網上拍賣大都會使服務價格下降，這可能是服務的不可持續性的反映。但運輸市場的價格，主要還是取決于供求，電子商務不會使運費進一步下降，而只是加快了運費下降的速度，市場中更好的溝通和信息將使價格迅速到達市場平衡點。
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